Эпилепсия, которая начинается в первый год жизни, часто имеет генетическую причину, но привычный путь обследования — анализ за анализом — бывает долгим. Международное исследование Gene-STEPS показало, что быстрое секвенирование всего генома вскоре после того, как у ребёнка началась эпилепсия, даёт ответ почти половине семей. Результаты 22 октября представили на ежегодном конгрессе Американского общества генетики человека (ASHG).
Кого обследовали
В исследование включили 515 детей младше 12 месяцев, у которых впервые появилась эпилепсия или сложные фебрильные судороги неясной причины. Их набирали в стационарах и амбулаторно в четырёх странах. По данным регистрации исследования на ClinicalTrials.gov, это детские больницы в Бостоне (США), Торонто (Канада), Мельбурне (Австралия) и Лондоне (Великобритания). Контрольной группы не было: исследование наблюдательное, сравнения с привычным поэтапным обследованием в данных нет. Геном секвенировали аккредитованные клинические лаборатории, результат обычно был готов примерно через три недели.
Что нашли
Генетический диагноз удалось поставить 228 детям — это 44%. Изменения обнаружили в 111 разных генах или участках генома, что показывает, насколько разнообразны причины эпилепсии у младенцев. Пять генов — PRRT2, SCN1A, KCNQ2, SCN8A и SCN2A — дали 37% всех диагнозов, а 82 диагноза встретились лишь у одного ребёнка каждый.
Более чем в половине поставленных диагнозов — то есть примерно у четверти всех обследованных детей — найденная причина повлияла на лечение, наблюдение или и то и другое. По предварительной оценке, 16% диагнозов потенциально подходят для антисмысловых олигонуклеотидов — нового класса препаратов, которые меняют работу РНК. Детям, у которых стандартный анализ не дал ответа, помогали дополнительные методы — секвенирование РНК и так называемое длиннопрочтённое секвенирование генома.
Вывод авторов
Докладчик Грегори Костейн от имени исследователей Gene-STEPS заключил, что быстрое секвенирование генома даёт клинически значимый ответ достаточно рано, чтобы повлиять на решения врачей, и его стоит рассматривать как генетический тест первой линии для младенцев с впервые возникшей эпилепсией.
На пилотном этапе Gene-STEPS, результаты которого в 2023 году опубликовал журнал Lancet Neurology, обследовали 100 младенцев и нашли диагноз у 43%. В регистрации исследования изначально был заявлен набор 300 детей, фактически включили 515.
Примечание редакции
Это доклад на конгрессе ASHG, полной статьи пока нет. Цифры взяты из пресс-релиза, страны мы нашли в регистрации исследования. Похожий результат, 43% диагнозов, Gene-STEPS уже показал в пилоте на 100 младенцах. Но группы сравнения нет, а 16% детей, которым могут подойти антисмысловые препараты, — пока оценка возможностей, а не готовые лекарства.